Det är den 10 februari 1982. Biståndsarbetaren och missionären Leif Zetterlund kör lastbil på en av de svårframkomliga vägarna i södra Sudan. Det är torrtid, dammet ryker och vad Leif inte märker är att en liten konvoj av landrovers försöker köra om. Men bilarna hamnar i terrängen, och trots upprepade ansatser tvingas de avbryta omkörningen.
Tio minuter senare, vid en vattenpump, blir Leif anklagad för mordförsök på en av Sudans ministrar. Det är upptakten till ett drama där Leif Zetterlund blir en bricka i ett intrikat maktspel
"Vattenkriget" är en thriller, men också berättelsen om en svensk u-landsarbetare som går egna vägar. Leif Zetterlund, född i Stockholm 1952, leder i dag ett eget hjälparbete med fem hundra anställda, nästan alla afrikaner.
Dessutom ger "Vattenkriget" inblickar i ett land som för de flesta svenskar är okänt: Sudan. Till ytan det största landet i Afrika men plågat av ett långvarigt inbördeskrig, och brist på mat och vatten.